Der überwiegende Anteil der Kinder (>95 %) wird durch perinatale Übertragung des Virus von der Mutter auf das Kind infiziert (Vertikale Infektion). Der horizontale Übertragungsweg des Erwachsenenalters durch Transfusion, Geschlechtsverkehr und Drogenmißbrauch hat in der Vergangenheit bei Kindern mit Hämophilie zu HIV-Infektionen durch Blutprodukte geführt. Aufgrund der verbesserten Screeninguntersuchungen stellt dieser Übertragungsweg inzwischen aber im Kindesalter in Deutschland eine Ausnahmesituation dar. Allerdings ist ein Teil der nach Deutschland eingewanderten HIV infizierten Kinder durch HIV kontaminierte Transfusionen in Entwicklungsländern infiziert worden.